Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
JrklB2RRL2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
JrklB2RRL2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
JrklB2RRL2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms