Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Phf3B2RQG2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Phf3B2RQG2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Phf3B2RQG2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms