Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mbd5B1AYB6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mbd5B1AYB6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Mbd5B1AYB6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Mbd5B1AYB6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms