Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grik3B1AS29 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik3B1AS29 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik3B1AS29 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms