Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmem238A9JSM3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem238A9JSM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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