Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF0

Skint3, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint3A7TZF0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Skint3A7TZF0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Skint3A7TZF0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint3A7TZF0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms