Protein–RNA interactions for Protein: A6BLY7

Krt28, Keratin, type I cytoskeletal 28, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt28A6BLY7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt28A6BLY7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt28A6BLY7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt28A6BLY7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt28A6BLY7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt28A6BLY7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms