Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttll9A2APC3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttll9A2APC3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms