Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FocadA2AKG8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FocadA2AKG8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FocadA2AKG8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms