Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ambra1A2AH22 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ambra1A2AH22 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ambra1A2AH22 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ambra1A2AH22 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms