Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2dnl2A2AFH2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms