Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pabpc1lA2A5N3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pabpc1lA2A5N3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pabpc1lA2A5N3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms