Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc173A0JLY1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc173A0JLY1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc173A0JLY1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms