Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIW3

Frmpd3, FERM and PDZ domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd3A0A140LIW3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd3A0A140LIW3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd3A0A140LIW3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd3A0A140LIW3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmpd3A0A140LIW3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmpd3A0A140LIW3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Frmpd3A0A140LIW3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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