Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm3550W4VSN7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Gm3550W4VSN7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm3550W4VSN7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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