Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ubl3Q9Z2M6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ubl3Q9Z2M6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms