Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Pdpk1Q9Z2A0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Pdpk1Q9Z2A0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pdpk1Q9Z2A0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdpk1Q9Z2A0 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms