Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cldn9Q9Z0S7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Cldn9Q9Z0S7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn9Q9Z0S7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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