Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PrkraQ9WTX2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms