Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rnf4Q9QZS2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf4Q9QZS2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms