Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Tomm40Q9QYA2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms