Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim44Q9QXA7 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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