Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk1eQ9JMK2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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