Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rabgef1Q9JM13 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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