Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Col5a3Q9JLI2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms