Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gde1Q9JL56 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gde1Q9JL56 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gde1Q9JL56 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Gde1Q9JL56 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gde1Q9JL56 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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