Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp6Q9ESX2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp6Q9ESX2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms