Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Hmg20aQ9DC33 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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