Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Csnk1dQ9DC28 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Csnk1dQ9DC28 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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