Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Swt1Q9DBQ9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Swt1Q9DBQ9 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms