Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Smg9Q9DB90 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smg9Q9DB90 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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