Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Derl3Q9D8K3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Derl3Q9D8K3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Derl3Q9D8K3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms