Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn22Q9D7U6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn22Q9D7U6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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