Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ttc9bQ9D6E4 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms