Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PudpQ9D5U5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms