Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Snx29Q9D3S3 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms