Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Trappc6bQ9D289 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms