Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Ube2cQ9D1C1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms