Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Zbed3Q9D0L1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Zbed3Q9D0L1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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