Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccdc47Q9D024 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ccdc47Q9D024 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ccdc47Q9D024 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Ccdc47Q9D024 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ccdc47Q9D024 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ccdc47Q9D024 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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