Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Shmt2Q9CZN7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Shmt2Q9CZN7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Shmt2Q9CZN7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms