Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ddx28Q9CWT6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ddx28Q9CWT6 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ddx28Q9CWT6 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ddx28Q9CWT6 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ddx28Q9CWT6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ddx28Q9CWT6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddx28Q9CWT6 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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