Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Snx10Q9CWT3 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Snx10Q9CWT3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Snx10Q9CWT3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Snx10Q9CWT3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Snx10Q9CWT3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms