Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Fcf1Q9CTH6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Fcf1Q9CTH6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms