Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nicn1Q9CQM0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms