Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 367.9 ms