Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Use1Q9CQ56 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Use1Q9CQ56 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Use1Q9CQ56 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Use1Q9CQ56 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Use1Q9CQ56 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Use1Q9CQ56 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Use1Q9CQ56 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Use1Q9CQ56 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Use1Q9CQ56 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
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Use1Q9CQ56 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Use1Q9CQ56 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Use1Q9CQ56 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Use1Q9CQ56 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms