Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Chmp3Q9CQ10 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Chmp3Q9CQ10 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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