Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdh23Q99PF4 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdh23Q99PF4 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdh23Q99PF4 Gm5071-201ENSMUST00000104922 1035 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdh23Q99PF4 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdh23Q99PF4 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdh23Q99PF4 Gm11365-201ENSMUST00000144277 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdh23Q99PF4 AC124503.1-201ENSMUST00000218524 526 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdh23Q99PF4 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdh23Q99PF4 Gm5072-201ENSMUST00000063726 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdh23Q99PF4 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cdh23Q99PF4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cdh23Q99PF4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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