Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rims1Q99NE5 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rims1Q99NE5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms